Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nlgn1Q99K10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nlgn1Q99K10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nlgn1Q99K10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nlgn1Q99K10 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nlgn1Q99K10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nlgn1Q99K10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nlgn1Q99K10 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nlgn1Q99K10 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nlgn1Q99K10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nlgn1Q99K10 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nlgn1Q99K10 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nlgn1Q99K10 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Nlgn1Q99K10 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms