Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf11Q99JX1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf11Q99JX1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Taf11Q99JX1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf11Q99JX1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf11Q99JX1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms