Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf2Q921K8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf2Q921K8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf2Q921K8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf2Q921K8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf2Q921K8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcaf2Q921K8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf2Q921K8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms