Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TardbpQ921F2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TardbpQ921F2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TardbpQ921F2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TardbpQ921F2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TardbpQ921F2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms