Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med28Q920D3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Med28Q920D3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Med28Q920D3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms