Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI51

Sorcs3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs3Q8VI51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sorcs3Q8VI51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sorcs3Q8VI51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorcs3Q8VI51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorcs3Q8VI51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorcs3Q8VI51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms