Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol9aQ8VDU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9aQ8VDU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol9aQ8VDU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol9aQ8VDU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol9aQ8VDU3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms