Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rprd1aQ8VDS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd1aQ8VDS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd1aQ8VDS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rprd1aQ8VDS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd1aQ8VDS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd1aQ8VDS4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms