Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam20bQ8VCS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam20bQ8VCS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam20bQ8VCS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam20bQ8VCS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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