Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan10Q8VCF5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan10Q8VCF5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan10Q8VCF5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan10Q8VCF5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan10Q8VCF5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan10Q8VCF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan10Q8VCF5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan10Q8VCF5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan10Q8VCF5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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