Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
McmbpQ8R3C0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
McmbpQ8R3C0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
McmbpQ8R3C0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
McmbpQ8R3C0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
McmbpQ8R3C0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
McmbpQ8R3C0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms