Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc12Q8R344 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc12Q8R344 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc12Q8R344 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc12Q8R344 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc12Q8R344 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms