Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps37bQ8R0J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps37bQ8R0J7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37bQ8R0J7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps37bQ8R0J7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps37bQ8R0J7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms