Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ncapd2Q8K2Z4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ncapd2Q8K2Z4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd2Q8K2Z4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ncapd2Q8K2Z4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd2Q8K2Z4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd2Q8K2Z4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncapd2Q8K2Z4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncapd2Q8K2Z4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms