Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T4

Uqcc3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uqcc3Q8K2T4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uqcc3Q8K2T4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uqcc3Q8K2T4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uqcc3Q8K2T4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uqcc3Q8K2T4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uqcc3Q8K2T4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms