Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd3Q8K2F0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brd3Q8K2F0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd3Q8K2F0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd3Q8K2F0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd3Q8K2F0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms