Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs1Q8K212 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacs1Q8K212 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pacs1Q8K212 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pacs1Q8K212 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacs1Q8K212 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacs1Q8K212 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms