Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0S9

Snapc1, snRNA-activating protein complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc1Q8K0S9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snapc1Q8K0S9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snapc1Q8K0S9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snapc1Q8K0S9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snapc1Q8K0S9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc1Q8K0S9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc1Q8K0S9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms