Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam20aQ8CID3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam20aQ8CID3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam20aQ8CID3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam20aQ8CID3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam20aQ8CID3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam20aQ8CID3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam20aQ8CID3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam20aQ8CID3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms