Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip4Q8CI96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clip4Q8CI96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clip4Q8CI96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clip4Q8CI96 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip4Q8CI96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms