Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnka2ipQ8CH19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnka2ipQ8CH19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnka2ipQ8CH19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csnka2ipQ8CH19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnka2ipQ8CH19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnka2ipQ8CH19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnka2ipQ8CH19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms