Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc43a2Q8CGA3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc43a2Q8CGA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc43a2Q8CGA3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc43a2Q8CGA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms