Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Setd1bQ8CFT2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Setd1bQ8CFT2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Setd1bQ8CFT2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Setd1bQ8CFT2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Setd1bQ8CFT2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Setd1bQ8CFT2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Setd1bQ8CFT2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Setd1bQ8CFT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Setd1bQ8CFT2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Setd1bQ8CFT2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Setd1bQ8CFT2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Setd1bQ8CFT2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Setd1bQ8CFT2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.5 ms