Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samd4aQ8CBY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd4aQ8CBY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4aQ8CBY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Samd4aQ8CBY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms