Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CntrobQ8CB62 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CntrobQ8CB62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CntrobQ8CB62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CntrobQ8CB62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CntrobQ8CB62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CntrobQ8CB62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CntrobQ8CB62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CntrobQ8CB62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms