Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubqln3Q8C5U9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubqln3Q8C5U9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubqln3Q8C5U9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubqln3Q8C5U9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms