Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac7Q8C2B3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac7Q8C2B3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac7Q8C2B3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac7Q8C2B3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms