Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ska3Q8C263 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ska3Q8C263 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ska3Q8C263 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ska3Q8C263 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ska3Q8C263 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ska3Q8C263 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms