Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TiparpQ8C1B2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TiparpQ8C1B2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TiparpQ8C1B2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TiparpQ8C1B2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TiparpQ8C1B2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TiparpQ8C1B2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms