Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Iffo1Q8BXL9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Iffo1Q8BXL9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Iffo1Q8BXL9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Iffo1Q8BXL9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms