Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trerf1Q8BXJ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trerf1Q8BXJ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trerf1Q8BXJ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trerf1Q8BXJ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trerf1Q8BXJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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