Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3dQ8BX13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube3dQ8BX13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ube3dQ8BX13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube3dQ8BX13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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