Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp398Q8BV16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp398Q8BV16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zfp398Q8BV16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp398Q8BV16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp398Q8BV16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms