Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp9Q8BTS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp9Q8BTS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp9Q8BTS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp9Q8BTS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp9Q8BTS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp9Q8BTS3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp9Q8BTS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp9Q8BTS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms