Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcgF3Q8BTQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
PcgF3Q8BTQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PcgF3Q8BTQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PcgF3Q8BTQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcgF3Q8BTQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcgF3Q8BTQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.8 ms