Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdhaf3Q8BQU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdhaf3Q8BQU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdhaf3Q8BQU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdhaf3Q8BQU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms