Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrps35Q8BJZ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrps35Q8BJZ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrps35Q8BJZ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrps35Q8BJZ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrps35Q8BJZ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrps35Q8BJZ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms