Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp1Q8BJQ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp1Q8BJQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp1Q8BJQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp1Q8BJQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp1Q8BJQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms