Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4933430I17RikQ8BHW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4933430I17RikQ8BHW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933430I17RikQ8BHW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933430I17RikQ8BHW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms