Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Samm50Q8BGH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Samm50Q8BGH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Samm50Q8BGH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samm50Q8BGH2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samm50Q8BGH2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Samm50Q8BGH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samm50Q8BGH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Samm50Q8BGH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samm50Q8BGH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samm50Q8BGH2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samm50Q8BGH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samm50Q8BGH2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms