Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc38a9Q8BGD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc38a9Q8BGD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc38a9Q8BGD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc38a9Q8BGD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc38a9Q8BGD6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc38a9Q8BGD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc38a9Q8BGD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc38a9Q8BGD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc38a9Q8BGD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc38a9Q8BGD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms