Protein–RNA interactions for Protein: Q812F8

Mgat4b, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4bQ812F8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mgat4bQ812F8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mgat4bQ812F8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mgat4bQ812F8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mgat4bQ812F8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mgat4bQ812F8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms