Protein–RNA interactions for Protein: Q811B3

Adamts12, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts12Q811B3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Adamts12Q811B3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Adamts12Q811B3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Adamts12Q811B3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Adamts12Q811B3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Adamts12Q811B3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Adamts12Q811B3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Adamts12Q811B3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Adamts12Q811B3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Adamts12Q811B3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Adamts12Q811B3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Adamts12Q811B3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Adamts12Q811B3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Adamts12Q811B3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Adamts12Q811B3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Adamts12Q811B3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Adamts12Q811B3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Adamts12Q811B3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Adamts12Q811B3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms