Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChfrQ810L3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChfrQ810L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChfrQ810L3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChfrQ810L3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChfrQ810L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChfrQ810L3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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