Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS6

Samd4b, Protein Smaug homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4bQ80XS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd4bQ80XS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd4bQ80XS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samd4bQ80XS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd4bQ80XS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd4bQ80XS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms