Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chn2Q80XD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chn2Q80XD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chn2Q80XD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chn2Q80XD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chn2Q80XD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chn2Q80XD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms