Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl29Q80T74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl29Q80T74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl29Q80T74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl29Q80T74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl29Q80T74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms