Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Robo2Q7TPD3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Robo2Q7TPD3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Robo2Q7TPD3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Robo2Q7TPD3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Robo2Q7TPD3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Robo2Q7TPD3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Robo2Q7TPD3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Robo2Q7TPD3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Robo2Q7TPD3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms