Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx4Q7TNK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx4Q7TNK1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx4Q7TNK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx4Q7TNK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx4Q7TNK1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms