Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd1l2Q7TN88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd1l2Q7TN88 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd1l2Q7TN88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkd1l2Q7TN88 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkd1l2Q7TN88 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms